Program Studi (Prodi) Pendidikan Agama Islam (PAI) merupakan salah satu dari 11 program studi yang ada di Sekolah Tinggi Agama Islam Negeri Sultan Abdurrahman Kepulauan Riau.
Prodi ini dianggap sebagai salah satu prodi yang istimewa di Kepulauan Riau dikarenakan Mahasiswanya memiliki tingkat kecerdasan dalam berpantun,berceramah,serta mengamalkan apa yang telah dipelajarinya di STAIN Sultan Abdurrahman. Awal mula berdirinya prodi ini dilatarbelakangi oleh antusiasme dalam rangka meningkatkan kualitas pendidikan Agama Islam yang ada di Indonesia khususnya Provinsi Kepulauan Riau.
Pada tanggal 09 Maret 2020 terbitlah surat keputusan dari Kementerian Agama nomor 213 Tahun 2020 tentang Izin Penyelenggaraan Program Studi Pendidikan Agama Islam STAIN Sultan Abdurrahman Kepulauan Riau.
Program Studi Pendidikan Agama Islam merupakan salah satu program studi berjenjang S1 pada STAIN Sultan Abdurrahman Kepulauan Riau. Program studi ini merupakan program studi yang berkonsentrasi dalam bidang pengajaran Agama Islam serta menghasilkan lulusan yang memiliki kompetensi dibidang pengajaran Agama Islam serta mampu untuk mengamalkan apa yang telah ia pelajari sebagai seorang lulusan prodi Pendidikan Agama Islam